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快速使用VASP 的简介、安装及使用

中国软件网2023-01-03中国软件问问题的软件
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快速使用VASP 的简介、安装及使用

快速使用VASP 的简介、安装及使用,

  bbox软件,问问题的软件,app办公软件VASP是目前最流行的第一性原理软件之一,但维也纳大学仅仅提供软件源代码,输入文件参数众多,一些输出文件需要进一步后处理才能可视化。目前用得比较多的软件有vaspkit、p4vasp、sumo、lev00、pwmat以及大神们在Github以及QQ群上传的各种脚本和二进制文件。基于此,历时近5年,如图一所示,qvasp定位于开发包含VASP输入文件前处理、输出文件后处理的基本功能,同时,也可以让用户根据自身研究方向,吸纳其它工具集,制定契合自己研究的自定义qvasp工具包。

  4、到安装包下的exefile/POTCAR/paw_*几个文件夹下补全VASP的赝势文件(商业软件,非开源部分)

  5、退出账号,重新登录,即可以使用qvasp -help获取帮助文档(如图二所示)

  帮助分为六个板块,其基本使用逻辑为qvasp -xxxx,比如qvasp -c2p C.cif,则可以将C.cif转换成POSCAR文件。当后面所接参数错误,比如qvasp -wrong,则会自动打印出帮助文档。

  每次计算几乎都会涉及电子步,也就是每个INCAR都包含图三中的INCAR-base,通过qvasp -md则可以合并INCAR-base和关于分子动力学参数INCAR-md,生成分子动力学的INCAR。仔细留意下安装目录中exefile/INCAR文件夹,你可以任意修改其中参数,以实现生成自定义的INCAR文件。

  如图三和图二帮助文档所示,就不加以赘述,可以查看其中文帮助文档和qvasp发表在computer physics communication上的文档。

  网上有各种各样非常有用的工具,相信各自手中也可能也有好用程序。你可以把它们放在自己账号环境变量中,也可以每次用的时候手动上传再加可执行权限。如何把这些分散的好用工具收集起来,制备成系统可迁移的程序包呢?qvasp提供了一个特殊的文件夹,位于exefile/Tools/USERTooLs,你可以把自己常用的脚本文件统一放于这个文件夹中,加上可执行权限,然后修改这个文件夹中help-ex文档来注释说明。

  以极其好用的vaspkit来举例(感谢王伟老师及合作开发者),将vaspkit可执行文件放于exefile/Tools/USERTooLs中赋予可执行权限,则可以使用qvasp -vaspkit调用这个可执行文件,同时修改help-ex文件增加其相应的说明,这样在qvasp -help的时候就能看到自定义的这个工具说明了。

  这样做有一个好处,就是在任意时候可以用qvasp -help弹出帮助文档来提示自己用哪个工具,并将所有工具收集在一起,需要迁移到别服务器时只需要用tar -zcPvf qvasp-v2.21.tar.gz qvasp-v2.21把整个qvasp-v2.21打包成包含适用于自我的工具包,上传另外一台服务器直接解压,执行./install.sh安装即可享受自己常用工具集的安装包了。

  qvasp英文paper近期发表于(可阅读正文和支持信息,了解各部分功能的原理)

  易文才,2018 年博士毕业于吉林大学理论化学研究所,目前在曲阜师范大学物理工程学院工作。目前主要研究方向:采用第一性原理计算和结构搜索算法,探究低维材料微观晶体结构和电子结构性质。通过结构搜索,挖掘材料微观结构与宏观性质之间的关系,并基于此设计新型低维多功能材料。研究兴趣包含:

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